Wykaz publikacji wybranego autora

Tomasz Gubała, mgr inż.

pracownik naukowo-techniczny

Akademickie Centrum Komputerowe ,,Cyfronet'' AGH
ACK-zwe, Zespół Współpracy Europejskiej

Identyfikatory Autora Informacje o Autorze w systemach zewnętrznych

ORCID: 0000-0002-3822-5163 połącz konto z ORCID

ResearcherID: brak

Scopus: 6508362673

System Informacyjny AGH (SkOs)

1
2

  • A distributed multiscale computation of a tightly coupled model using the Multiscale Modeling Language / Joris Borgdorff, [et al.], Katarzyna RYCERZ, Eryk CIEPIELA, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Marian BUBAK, [et al.] // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2012 vol. 9, s. 596–605. — Bibliogr. s. 605, Abstr.. — Proceedings of the International Conference on Computational Science, ICCS 2012

  • keywords: multi-scale modelling, MML, in stent restenosis, MUSCLE, QCG-Broker, Gridspace, distributed multi-scale computing, multi-scale modelling language

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Katarzyna Rycerz, Eryk Ciepiela, Daniel Harężlak

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2012.04.064

3

  • Building collaborative applications for system-level science / Marian BUBAK, Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI // W: High speed and large scale scientific computing / eds. Wolfgang Gentzsch, Lucio Grandinetti, Gerhard Joubert. — Amsterdam : IOS Press, cop. 2009. — (Advances in Parallel Computing ; ISSN 0927-5452 ; vol. 18). — ISBN: 978-1-60750-073-5. — S. 299–310. — Bibliogr. s. 309–310, Abstr.. — M. Bubak – dod. afiliacja: Informatics Institute, University of Amsterdam

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Marek Kasztelnik

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

4

  • Centre for new methods in computational diagnostics and personalized therapy / Marian BUBAK, Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Eryk CIEPIELA, Grzegorz DYK, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Joanna KOCOT, Maciej MALAWSKI, Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej PAWLIK, Katarzyna RYCERZ, Paweł SUDER, Tomasz SZEPIENIEC, Bartosz WILK // W: CGW Workshop'17 : Kraków, Poland, October 23-25, 2017 : proceedings / eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr. — Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET AGH, [2017]. — ISBN: 978-83-61433-24-8. — S. 67–68. — Bibliogr. s. 68. — Toż. na: {http://www.eurvalve.eu/wp-content/uploads/2017/11/Cyfronet-%C5%9Brodek_Proceedings.pdf}. — Dod. na stronie konferencji prezentacja {http://www.cyfronet.krakow.pl/cgw17/presentations/S8_5-M-Bubak.pdf}

  • keywords: personalized medicine, teaming, centre of excellence, computational medicine, business plan, H2020, Polish Smart Specialization Strategy

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

5
6

  • Component-based approach for programming and running scientific applications on grids and clouds / Maciej MALAWSKI, Tomasz GUBAŁA, Marian BUBAK // The International Journal of High Performance Computing Applications ; ISSN 1094-3420. — 2012 vol. 26 iss. 3, s. 275–295. — Bibliogr. s. 292–295, Abstr.. — M. Malawski dod. afiliacja: Center for Research Computing, University of Notre Dame, USA ; T. Gubała, M. Bubak dod. afiliacja: Informatics Institute, Universiteit van Amsterdam, The Netherlands

  • keywords: distributed applications, grid computing, cloud computing, component programming, programming model

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1177/1094342011422924

7
8

  • Enabling multiscale fusion simulations on distributed computing resources / Katarzyna RYCERZ, Marian BUBAK, Eryk CIEPIELA, Maciej PAWLIK, Olivier Hoenen, Daniel HARĘŻLAK, Bartosz WILK, Tomasz GUBAŁA, Jan MEIZNER, David Coster // W: eScience on distributed computing infrastructure : achievements of PLGrid Plus domain-specific services and tools / eds. Marian Bubak, Jacek Kitowski, Kazimierz Wiatr. — Switzerland : Springer International Publishing, cop. 2014 + CD. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 8500. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — ISBN: 978-3-319-10893-3 ; e-ISBN: 978-3-319-10894-0. — S. 195–210. — Bibliogr. s. 207–210, Abstr.

  • keywords: distributed computing, fusion, workflow, e-infrastructures, multi-scale, tools and environments, multi-physics

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

9

  • High-level API for managing computations on the HPC systems / Marek KASZTELNIK, Tomasz GUBAŁA, Piotr NOWAKOWSKI, Jan MEIZNER, Piotr POŁEĆ, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: KU KDM 2022 : fourteenth ACC Cyfronet AGH HPC users' conference : online, 7-8 April 2022 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2022. — ISBN: 978-83-61433-40-8. — S. 23–24. — Bibliogr. s. 24. — T. Gubała, P. Nowakowski, J. Meizner, M. Malawski, M. Bubak - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Krakow, Poland

  • keywords: PLGrid, MEE, GridFTP, GSI SSH, REST API

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Marek Kasztelnik, Jan Meizner, Piotr Połeć

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

10

  • Managing entire lifecycles of e-science applications in the GridSpace2 virtual laboratory – from motivation through idea to operable Web-accessible environment built on top of PL-Grid e-infrastructure / Eryk CIEPIELA, Piotr NOWAKOWSKI, Joanna KOCOT, Daniel HARĘŻLAK, Tomasz GUBAŁA, Jan MEIZNER, Marek KASZTELNIK, Tomasz BARTYŃSKI, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 228–239. — Bibliogr. s. 238–239, Abstr.. — T. Gubała, M. Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

11

  • PRIMAGE project: predictive \emph{in silico} multiscale analytics to support childhood cancer personalised evaluation empowered by imaging biomarkers / Luis Martí-Bonmatí, [et al.], Marian BUBAK, [et al.], Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, [et al.] // European Radiology Experimental [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 2509-9280. — 2020 vol. 4 iss. 1 art. no. 22, s. 1–11. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 10–11, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2020-04-03. — tekst: https://eurradiolexp.springeropen.com/track/pdf/10.1186/s41747-020-00150-9

  • keywords: tumor, cloud computing, biomarkers, artificial intelligence, diffuse intrinsic pontine glioma, neuroblastoma

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Piotr Nowakowski, Marek Kasztelnik, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1186/s41747-020-00150-9

12

  • Secure file storage and access mechanisms in a multi-tenant environment / Jan MEIZNER, Marian BUBAK, Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI // W: KU KDM 2022 : fourteenth ACC Cyfronet AGH HPC users' conference : online, 7-8 April 2022 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2022. — ISBN: 978-83-61433-40-8. — S. 21–22. — Bibliogr. s. 22. — J. Meizner, M. Bubak, T. Gubała, M. Malawski, P. Nowakowski - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Krakow, Poland

  • keywords: security, HPC, FUSE, clouds, webdav, file storage

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Piotr Nowakowski, Marek Kasztelnik, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

13

  • Semantic integration for research environments / Tomasz GUBAŁA, Marian BUBAK, Peter M. A. Sloot // W: Handbook of research on computational grid technologies for life sciences, biomedicine, and healthcare, Vol. 1 / ed. Mario Cannataro. — [Hershey] : Medical Information Science Reference, cop. 2009. — ISBN: 978-1-60566-374-6. — S. 514–530

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

14
15

  • The UrbanFlood Common Information Space for early warning systems / Bartosz BALIŚ, Marek KASZTELNIK, Marian BUBAK, Tomasz BARTYŃSKI, Tomasz GUBAŁA, Piotr NOWAKOWSKI, Jeroen Broekhuijsen // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2011 vol. 4 spec. iss., s. 96–105. — Bibliogr. s. 105, Abstr.. — ICCS 2011 : International Conference on Computational Science : [Singapore, 1–3 June 2011]

  • keywords: common information space, early warning system, software framework, Service Oriented Architecture, legacy applications

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Bartosz Baliś, Piotr Nowakowski, Marek Kasztelnik, Tomasz Bartyński

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2011.04.011

16

  • Towards a system-level science support / Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: Computational Science – ICCS 2008 : 8th International Conference : Kraków, Poland, June 23–25, 2008 : proceedings, Pt. 1 / eds. Marian Bubak, Geert Dick van Albada, Jack Dongarra, Peter M. A. Sloot. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2008 + CD-ROM. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 5101. Theoretical Computer Science and General Issues ; ISSN 2512-2010). — Dołączony CD-ROM zawiera pełne teksty referatów z pt. 1, pt. 2, pt. 3. — ISBN: 978-3-540-69383-3 ; ISBN10: 3-540-69383-1 ; e-ISBN: 978-3-540-69384-0. — S. 56–65. — Bibliogr. s. 64–65, Abstr.

  • keywords: e-science, collaborative applications, virtual laboratory, system-level science, ViroLab

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Marek Kasztelnik

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

17

  • Towards interactive access to supercomputing resources at Cyfronet using JupyterHub / Maciej MALAWSKI, Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Jan MEIZNER, Klemens NOGA, Łukasz FLIS // W: KU KDM 2022 : fourteenth ACC Cyfronet AGH HPC users' conference : online, 7-8 April 2022 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2022. — ISBN: 978-83-61433-40-8. — S. 25–26. — Bibliogr. s. 26. — M. Malawski, T. Gubała, J. Meizner - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Krakow, Poland

  • keywords: interactive, supercomputing, Jupyter

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Maciej Malawski, Marek Kasztelnik, Łukasz Flis, Jan Meizner, Klemens Noga

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

18

  • Universal Grid client: Grid Operation Invoker / Tomasz Bartyński, Maciej MALAWSKI, Tomasz GUBAŁA, Marian BUBAK // W: Parallel Processing and Applied Mathematics : 7th international conference, PPAM 2007 : Gdańsk, Poland, September 9–12, 2007 : revised selected papers / eds. Roman Wyrzykowski, [et al.]. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2008. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 4967. Theoretical Computer Science and General Issues ; ISSN 2512-2010). — ISBN: 978-3-540-68105-2 ; ISBN10: 3-540-68105-1 ; e-ISBN: 978-3-540-68111-3. — S. 1068–1077. — Bibliogr. s. 1076–1077, Abstr.

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

19

  • Virtual laboratory for collaborative applications / Marian BUBAK, Maciej MALAWSKI, Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Piotr NOWAKOWSKI, Daniel Harezlak, Tomasz Bartynski, Joanna KOCOT, Eryk CIEPIELA, Włodzimierz FUNIKA, Dariusz Krol, Bartosz BALIŚ, Matthias Assel, Alfredo Tirado-Ramos // W: Handbook of research on computational grid technologies for life sciences, biomedicine, and healthcare, Vol. 1 / ed. Mario Cannataro. — [Hershey] : Medical Information Science Reference, cop. 2009. — ISBN: 978-1-60566-374-6. — S. 531–551

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu: