Cloud computing infrastructure for the VPH community / Piotr NOWAKOWSKI, Marian BUBAK, Tomasz BARTYŃSKI, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Jan MEIZNER // Journal of Computational Science ; ISSN 1877-7503. — 2018 vol. 24, s. 169–179. — Bibliogr. s. 178–179, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2017-06-21. — M. Bubak, M. Malawski – dod. afiliacja: ACC Cyfronet AGH. — tekst: https://www-1sciencedirect-1com-1000027eh02cb.wbg2.bg.agh.edu.pl/science/article/pii/S1877750317307330/pdfft?md5=942e1421b9d5beee97b74563b8470338&pid=1-s2.0-S1877750317307330-main.pdf

Computations of protein hydrophobicity profile as virtual experiment in GridSpace virtual laboratory / Eryk CIEPIELA, Tomasz JADCZYK, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Piotr NOWAKOWSKI, Grzegorz DYK, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK, Irena Roterman // Bio-Algorithms and Med-Systems / Jagiellonian University. Medical College ; ISSN 1895-9091. — 2012 vol. 8 no. 4, s. 361–372. — Bibliogr. s. 371–372, Abstr.

CrossGrid: an EU integrated project / Marian BUBAK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Robert PAJĄK, Katarzyna RYCERZ // Foundations of Computing and Decision Sciences ; ISSN 0867-6356. — 2004 vol. 29 no. 1–2 spec. iss.: Software engineering, s. 25–42. — Bibliogr. s. 42, Abstr.. — Dod. afiliacja Autorów: ACC CYFRONET AGH. — tekst: http://fcds.cs.put.poznan.pl/FCDS/ArticleDetails.aspx?articleId=52

Dedicated IT infrastructure for smart levee monitoring and flood decision support / Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Robert BRZOZA-WOCH, Marian BUBAK, Daniel HARĘŹLAK, Marek KASZTELNIK, Marek KONIECZNY, Bartosz KWOLEK, Maciej MALAWSKI, Piotr NAWROCKI, Piotr NOWAKOWSKI, Tomasz SZYDŁO, Bartosz WILK, Krzysztof ZIELIŃSKI // E3S Web of Conferences [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 2267-1242. — 2016 vol. 7 art. no. 14008, s. 1–10. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Tryb dostępu: https://goo.gl/bRuafq [2016-12-07]. — Bibliogr. s. 9–10, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2016-10-20. — FLOODrisk 2016 : 3\textsuperscript{rd} European conference on Flood Risk Management : October 17–21, 2016, Lyon, France

Execution management and efficient resource provisioning for flood decision support / Bartosz BALIŚ, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Bartosz WILK, Maciej PAWLIK, Marian BUBAK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2015 vol. 51, s. 2377–2386. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2385–2386, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2015-06-01. — International Conference On Computational Science : ICCS 2015 Computational Science at the Gates of Nature. — tekst: http://goo.gl/DRNpeY

Holistic approach to management of IT infrastructure for environmental monitoring and decision support systems with urgent computing capabilities / Bartosz BALIŚ, Robert BRZOZA-WOCH, Marian BUBAK, Marek KASZTELNIK, Bartosz KWOLEK, Piotr NAWROCKI, Piotr NOWAKOWSKI, Tomasz SZYDŁO, Krzysztof ZIELIŃSKI // Future Generation Computer Systems ; ISSN 0167-739X. — 2018 vol. 79 Pt. 1, s. 128–143. — Bibliogr. s. 142–143, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2016-08-31. — tekst: https://goo.gl/Rg2uNB

PRIMAGE project: predictive \emph{in silico} multiscale analytics to support childhood cancer personalised evaluation empowered by imaging biomarkers / Luis Martí-Bonmatí, [et al.], Marian BUBAK, [et al.], Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, [et al.] // European Radiology Experimental [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 2509-9280. — 2020 vol. 4 iss. 1 art. no. 22, s. 1–11. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 10–11, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2020-04-03. — tekst: https://eurradiolexp.springeropen.com/track/pdf/10.1186/s41747-020-00150-9

PROCESS data infrastructure and data services / Reginald Cushing, [et al.], Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, [et al.] // Computing and Informatics / Slovak Academy of Sciences. Institute of Informatics ; ISSN 1335-9150. — Tytuł poprz.: Computers and Artificial Intelligence. — 2020 vol. 39 no. 4, s. 724–756. — Bibliogr. s. 749–753, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2021-01-12. — tekst: http://www.cai.sk/ojs/index.php/cai/article/view/2020_4_724/1046

Quilt: interactive publications / Marian BUBAK, Piotr NOWAKOWSKI, Eryk CIEPIELA // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2011 vol. 7 spec. iss., s. 301–302. — Abstr.. — W spisie treści informacja: Original research article. — M. Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam. — FET 11 : proceedings of the 2nd European Future Technologies conference and exhibition 2011 : 4–6 May 2011 Budapest, Hungary / eds. Elisabeth Giacobino, Rolf Pfeifer. — tekst: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877050911005862/pdfft?md5=5bd8f582d54bd4fbcfce67a6744c316f&pid=1-s2.0-S1877050911005862-main.pdf

Smart levee monitoring and flood decision support system: reference architecture and urgent computing management / Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Marian BUBAK, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej PAWLIK, Bartosz WILK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2017 vol. 108, s. 2220–2229. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2228–2229, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2017-06-09. — ICCS 2017 : International Conference on Computational Science : 12–14 June 2017, Zurich, Switzerland. — tekst: https://goo.gl/a5dXx1

Support for Taverna workflows in the VPH-Share cloud platform / Marek KASZTELNIK, Ernesto Coto, Marian BUBAK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Juan Arenas, Alfredo Saglimbeni, Debora Testi, Alejandro F. Frangi // Computer Methods and Programs in Biomedicine ; ISSN 0169-2607. — 2017 vol. 146, s. 37–46. — Bibliogr. s. 45–46, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 20-05-2017. — M. Bubak, M. Malawski - dod. afiliacja: ACC Cyfronet AGH. — tekst: https://goo.gl/Q9cykt

The collage authoring environment: from proof-of-concept prototype to pilot service / Eryk CIEPIELA, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Jan MEIZNER, Grzegorz DYK, Piotr NOWAKOWSKI, Marian BUBAK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2013 vol. 18, s. 769–778. — Bibliogr. s. 778, Abstr.. — M. Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam. — ICCS 2013 : 13\textsuperscript{th} annual International Conference on Computational Science : 5th–7th June 2013, Barcelona, Spain. — tekst: http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877050913003840/pdf?md5=4896b2fbe119c01a65840334c4d5faf3&pid=1-s2.0-S1877050913003840-main.pdf

The Collage Authoring Environment / Piotr NOWAKOWSKI, Eryk CIEPIELA, Daniel HARĘŻLAK, Joanna KOCOT, Marek KASZTELNIK, Tomasz BARTYŃSKI, Jan MEIZNER, Grzegorz Dyk, Maciej MALAWSKI // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2011 vol. 4 spec. iss., s. 608–617. — Bibliogr. s. 617, Abstr.. — Dod. afiliacja M. Malawski: Center for Research Computing, University of Notre Dame, USA. — W spisie treści informacja: Original Research Article. — ICCS 2011 : proceedings of the International Conference on Computational Science : Singapore, Japan, June 1–3, 2011

The UrbanFlood Common Information Space for early warning systems / Bartosz BALIŚ, Marek KASZTELNIK, Marian BUBAK, Tomasz BARTYŃSKI, Tomasz GUBAŁA, Piotr NOWAKOWSKI, Jeroen Broekhuijsen // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2011 vol. 4 spec. iss., s. 96–105. — Bibliogr. s. 105, Abstr.. — ICCS 2011 : International Conference on Computational Science : [Singapore, 1–3 June 2011]

Towards an operational database for real-time environmental monitoring and early warning systems / Bartosz BALIŚ, Marian BUBAK, Daniel HARĘŻLAK, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej PAWLIK, Bartosz WILK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2017 vol. 108, s. 2250–2259. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2259, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2017-06-09. — ICCS 2017 : International Conference on Computational Science : 12–14 June 2017, Zurich, Switzerland. — tekst: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1877050917307846/pdf?md5=b9b8df45fb907680c241be0e26fbd30b&pid=1-s2.0-S1877050917307846-main.pdf

Towards exascale computing architecture and its prototype: services and infrastructure / Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, Jan KAPAŁA, Patryk WÓJTOWICZ, Marian BUBAK, Viet Tran, Martin Bobák, Maximilian Höb // Computing and Informatics / Slovak Academy of Sciences. Institute of Informatics ; ISSN 1335-9150. — Tytuł poprz.: Computers and Artificial Intelligence. — 2020 vol. 39 iss. 4, s. 860–880. — Bibliogr. s. 876–878, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2021-01-12. — J. Meizner, P. Nowakowski - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Krakow; M. Bubak - dod. afiliacje: ACC Cyfronet AGH; Sano Centre for Computational Medicine Krakow. — tekst: http://www.cai.sk/ojs/index.php/cai/article/view/2020_4_860/1051

Virtual patients in a behavioral medicine massive open online course (MOOC): a case-based analysis of technical capacity and user navigation pathways / Andrzej A. Kononowicz, Anne H. Berman, Natalia Stathakarou, Cormac McGrath, Tomasz BARTYŃSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej MALAWSKI, Nabil Zary // JMIR Medical Education ; ISSN 2369-3762. — 2015 vol. 1 iss. 2, s. 1–17, e8. — Bibliogr. s. 15–16, Abstr.

Virtual patients in massive open online courses: a technical toolbox / Kononowicz A., Stathakarou N., Berman A., McGrath C., BARTYŃSKI T., NOWAKOWSKI P., MALAWSKI M., Zary N. // Bio-Algorithms and Med-Systems / Jagiellonian University. Medical College ; ISSN 1895-9091. — 2015 vol. 11 iss. 2 spec. iss.: E-learning techniques in medicine / guest eds.: Inga Hege and Andrzej A. Kononowicz, s. eA18. — MCSB 2015 : international conference Cybernetic Modelling of Biological Systems : Kraków (Poland), 14–15 May 2015. — tekst: https://tiny.pl/9lj3n

Wirtualne laboratorium projektu PL-Grid a nauki przyrodnicze — The PL-Grid virtual laboratory for the life sciences domain / Maciej MALAWSKI, Eryk CIEPIELA, Tomasz GUBAŁA, Piotr NOWAKOWSKI, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Joanna KOCOT, Tomasz BARTYŃSKI, Marian BUBAK // Bio-Algorithms and Med-Systems / Jagiellonian University. Medical College ; ISSN 1895-9091. — 2010 vol. 6 no. 12 Suppl. no. 1, s. 117–120. — Bibliogr. s. 118, 120. — Tekst pol.-ang.. — MCSB 2010 : Modelowanie Cybernetyczne Systemów Biologicznych / Zakład Bioinformatyki i Telemedycyny. Uniwersytet Jagielloński. Collegium Medicum, Laboratorium Biocybernetyki. Katedra Automatyki. Akademia Górniczo-Hutnicza w Krakowie. — Kraków : CMUJ, 2010. — tekst: https://bit.wl.cm.uj.edu.pl/cm/uploads/2021/02/bams6_12_supl.pdf