Wykaz publikacji wybranego autora

Piotr Nowakowski, mgr inż.

pracownik naukowo-techniczny

Akademickie Centrum Komputerowe ,,Cyfronet'' AGH
ACK-zwe, Zespół Współpracy Europejskiej

Identyfikatory Autora Informacje o Autorze w systemach zewnętrznych

ORCID: 0000-0002-2369-3685 połącz konto z ORCID

ResearcherID: brak

Scopus: 24475061000

System Informacyjny AGH (SkOs)

1

  • A collaborative environment allowing clinical investigations on integrated biomedical databases / Matthias Assel, [et al.], Piotr NOWAKOWSKI, Marian BUBAK, [et al.] // W: Healthgrid research, innovation and business case : proceedings of HealthGrid 2009 : 29 June – 1 July, Berlin / Ed. Tony Solomonides, Martin Hofmann-Apitius, Mathias Freudigmann, Sebastian Claudius Semler, Yannick Legré, Mary Kratz. — Amsterdam ; Berlin ; Tokyo ; Washington, DC, 2009. — (Studies in Health Technology and Informatics ; ISSN 0926-9630 ; vol. 147). — ISBN: 978-1-60750-027-8. — S. 51–61. — Bibliogr. s. 61, Abstr.

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.3233/978-1-60750-027-8-51

2

  • Centre for new methods in computational diagnostics and personalized therapy / Marian BUBAK, Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Eryk CIEPIELA, Grzegorz DYK, Tomasz GUBAŁA, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Joanna KOCOT, Maciej MALAWSKI, Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej PAWLIK, Katarzyna RYCERZ, Paweł SUDER, Tomasz SZEPIENIEC, Bartosz WILK // W: CGW Workshop'17 : Kraków, Poland, October 23-25, 2017 : proceedings / eds. Marian Bubak, Michał Turała, Kazimierz Wiatr. — Kraków : Academic Computer Centre CYFRONET AGH, [2017]. — ISBN: 978-83-61433-24-8. — S. 67–68. — Bibliogr. s. 68. — Toż. na: {http://www.eurvalve.eu/wp-content/uploads/2017/11/Cyfronet-%C5%9Brodek_Proceedings.pdf}. — Dod. na stronie konferencji prezentacja {http://www.cyfronet.krakow.pl/cgw17/presentations/S8_5-M-Bubak.pdf}

  • keywords: personalized medicine, teaming, centre of excellence, computational medicine, business plan, H2020, Polish Smart Specialization Strategy

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

3
4

  • Computations of protein hydrophobicity profile as virtual experiment in GridSpace virtual laboratory / Eryk CIEPIELA, Tomasz JADCZYK, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Piotr NOWAKOWSKI, Grzegorz DYK, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK, Irena Roterman // Bio-Algorithms and Med-Systems / Jagiellonian University. Medical College ; ISSN 1895-9091. — 2012 vol. 8 no. 4, s. 361–372. — Bibliogr. s. 371–372, Abstr.

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

5
6

  • Digital twin simulation development and execution on HPC infrastructures / Marek KASZTELNIK, Piotr NOWAKOWSKI, Jan MEIZNER, Maciej MALAWSKI, Adam Nowak, Krzysztof Gadek, Karol Zając, Antonino Amedeo La Mattina, Marian Bubak // W: Computational Science – ICCS 2023 : 23rd international conference : Prague, Czech Republic, July 3–5, 2023 : proceedings, Pt. 2 / eds. Jiří Mikyška [et al.]. — Cham, Switzerland : Springer, cop. 2023. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 14074). — ISBN: 978-3-031-36020-6 ; e-ISBN: 978-3-031-36021-3. — S. 18–32. — Bibliogr., Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2023-06-26. — P. Nowakowski, J. Meizner, M. Malawski - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Kraków

  • keywords: HPC, personalized medicine, digital execution environment, digital shadow

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Maciej Malawski, Marek Kasztelnik, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1007/978-3-031-36021-3_2

7

  • Evaluation of cloud providers for VPH applications / Marian BUBAK, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, Susheel Varma // W: CCGrid 2013 [Dokument elektroniczny] : 13th IEEE/ACM international symposium on Cluster, cloud, and grid computing : 13–16 May 2013, Delft : proceedings / eds. Pavan Balaji, Dick Epema, Thomas Fahringer. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — [Los Alamitos] : IEEE, cop. 2013. — ISBN: 978-0-7695-4996-5. — S. 200–201. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 201, Abstr.. — tekst: http://ieeexplore.ieee.org/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=6546092

  • keywords: cloud computing, scientific applications, performance evaluation, Virtual Physiological Human

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Marek Kasztelnik, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1109/CCGrid.2013.54

8

  • Exascale computing and data architectures for brownfield applications / Martin Bobák, Adam S. Z. Belloum, Piotr NOWAKOWSKI, Jan MEIZNER, Marian BUBAK, Matti Heikkurinen, Ondrej Habala, Ladislav Hluchý // W: ICNC-FSKD 2018 [Dokument elektroniczny] : 14\textsuperscript{th} International Conference on Natural Computation, Fuzzy Systems and Knowledge Discovery : Huangshan, China 28-30 July, 2018 / eds. Maozhen Li, [et al.]. — Wersja do Windows. — Dane tekstowe. — [Piscataway] : IEEE, cop. 2018. — Dod. ISBN: 978-1-5386-8096-4, 978-1-5386-8098-8. — e-ISBN: 978-1-5386-8097-1. — S. 450–457. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 457, Abstr.. — tekst: https://ieeexplore-1ieee-1org-1000047u100e2.wbg2.bg.agh.edu.pl/stamp/stamp.jsp?tp=&arnumber=8686900

  • keywords: architecture, exascale computing, exascale data management, functional design, brownfield applications

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1109/FSKD.2018.8686900

9

  • Execution management and efficient resource provisioning for flood decision support / Bartosz BALIŚ, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Bartosz WILK, Maciej PAWLIK, Marian BUBAK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2015 vol. 51, s. 2377–2386. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2385–2386, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2015-06-01. — International Conference On Computational Science : ICCS 2015 Computational Science at the Gates of Nature. — tekst: http://goo.gl/DRNpeY

  • keywords: cloud computing, resource provisioning, scientific workflows, urgent computing, flood decision support, flood threat assessment, execution management

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Bartosz Baliś, Maciej Malawski, Marek Kasztelnik, Maciej Pawlik, Bartosz Wilk

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2015.05.412

10

  • Flexible and extendable mechanism enabling secure access to e-infrastructures and storage of confidential data for the GridSpace2 virtual laboratory / Jan MEIZNER, Eryk CIEPIELA, Piotr NOWAKOWSKI, Joanna KOCOT, MAciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 89–101. — Bibliogr. s. 100–101, Abstr.. — Marian Bubak – dod. afiliacja: Informatics Institute, University of Amsterdam, The Netherlands

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Eryk Ciepiela, Joanna Kocot, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

11

  • Heterogeneous exascale computing / Ladislav Hluchý, [et al.], Piotr NOWAKOWSKI, Jan MEIZNER, Katarzyna RYCERZ, Bartosz WILK, Marian BUBAK, [et al.] // W: Recent Advances in Intelligent Engineering : volume dedicated to Imre J. Rudas' Seventieth Birthday / eds. Levente Kovács, Tamás Haidegger, Anikó Szakál. — Cham : Springer Nature Switzerland AG, cop. 2020. — (Topics in Intelligent Engineering and Informatics ; ISSN 2193-9411 ; vol. 14). — ISBN: 978-3-030-14349-7 ; e-ISBN: 978-3-030-14350-3. — S. 81–110. — Bibliogr., Abstr.

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Katarzyna Rycerz, Jan Meizner, Bartosz Wilk

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1007/978-3-030-14350-3_5

12

  • High-level API for managing computations on the HPC systems / Marek KASZTELNIK, Tomasz GUBAŁA, Piotr NOWAKOWSKI, Jan MEIZNER, Piotr POŁEĆ, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: KU KDM 2022 : fourteenth ACC Cyfronet AGH HPC users' conference : online, 7-8 April 2022 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2022. — ISBN: 978-83-61433-40-8. — S. 23–24. — Bibliogr. s. 24. — T. Gubała, P. Nowakowski, J. Meizner, M. Malawski, M. Bubak - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Krakow, Poland

  • keywords: PLGrid, MEE, GridFTP, GSI SSH, REST API

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Tomasz Gubała, Marek Kasztelnik, Jan Meizner, Piotr Połeć

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

13
14

  • Integrating and accessing medical data resources within the ViroLab Virtual Laboratory / Matthias Assel, Piotr NOWAKOWSKI, Marian BUBAK // W: Computational Science – ICCS 2008 : 8th International Conference : Kraków, Poland, June 23–25, 2008 : proceedings, Pt. 3 / eds. Marian Bubak, Geert Dick van Albada, Jack Dongarra, Peter M. A. Sloot. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2008. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 5103. Theoretical Computer Science and General Issues ; ISSN 2512-2010). — ISBN: 978-3-540-69388-8 ; ISBN10: 3-540-69-388-2 ; e-ISBN: 978-3-540-69389-5. — S. 90–99. — Bibliogr. s. 98–99, Abstr.

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

15

  • Managing entire lifecycles of e-science applications in the GridSpace2 virtual laboratory – from motivation through idea to operable Web-accessible environment built on top of PL-Grid e-infrastructure / Eryk CIEPIELA, Piotr NOWAKOWSKI, Joanna KOCOT, Daniel HARĘŻLAK, Tomasz GUBAŁA, Jan MEIZNER, Marek KASZTELNIK, Tomasz BARTYŃSKI, Maciej MALAWSKI, Marian BUBAK // W: Building a national distributed e-infrastructure – PL-Grid : scientific and technical achievements / eds. Marian Bubak, Tomasz Szepieniec, Kazimierz Wiatr. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2012. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 7136. Information Systems and Applications, incl. Internet/Web, and HCI). — Na okł. dod.: State-of-the-art survey ; Applications, Development and execution tools, VO and security systems, Basic services, Grid resources. — ISBN: 978-3-642-28266-9. — S. 228–239. — Bibliogr. s. 238–239, Abstr.. — T. Gubała, M. Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

16

  • Negative feedback inhibition – fundamental biological regulation in cells and organisms / Jakub WACH, Marian BUBAK, Piotr NOWAKOWSKI, Irena Roterman, Leszek Konieczny, Katarzyna Chłopaś // W: Simulations in medicine : pre-clinical and clinical applications / ed. Irena Roterman-Konieczna. — Berlin ; Boston : Walter de Gruyter GmbH, cop. 2015. — Dod. e-ISBN (EPUB) 978-3-11-040644-3. — ISBN: 978-3-11-040626-9 ; e-ISBN: 978-3-11-040634-4. — S. 31–55

  • brak zdefiniowanych słów kluczowych

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Jakub Wach

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

17

  • PRIMAGE project: predictive \emph{in silico} multiscale analytics to support childhood cancer personalised evaluation empowered by imaging biomarkers / Luis Martí-Bonmatí, [et al.], Marian BUBAK, [et al.], Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, [et al.] // European Radiology Experimental [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 2509-9280. — 2020 vol. 4 iss. 1 art. no. 22, s. 1–11. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 10–11, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2020-04-03. — tekst: https://eurradiolexp.springeropen.com/track/pdf/10.1186/s41747-020-00150-9

  • keywords: tumor, cloud computing, biomarkers, artificial intelligence, diffuse intrinsic pontine glioma, neuroblastoma

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Tomasz Gubała, Marek Kasztelnik, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1186/s41747-020-00150-9

18

  • PROCESS data infrastructure and data services / Reginald Cushing, [et al.], Jan MEIZNER, Piotr NOWAKOWSKI, [et al.] // Computing and Informatics / Slovak Academy of Sciences. Institute of Informatics ; ISSN 1335-9150. — Tytuł poprz.: Computers and Artificial Intelligence. — 2020 vol. 39 no. 4, s. 724–756. — Bibliogr. s. 749–753, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2021-01-12. — tekst: http://www.cai.sk/ojs/index.php/cai/article/view/2020_4_724/1046

  • keywords: exascale data management, microservice architecture, distributed file systems

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.31577/cai_2020_4_724

19
20

  • Sano: a medical research centre with an international research agenda / Arkadiusz Sitek, Marian BUBAK, Piotr NOWAKOWSKI // W: KU KDM 2022 : fourteenth ACC Cyfronet AGH HPC users' conference : online, 7-8 April 2022 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2022. — ISBN: 978-83-61433-40-8. — S. 59–61. — Bibliogr. s. 61. — M. Bubak, P. Nowakowski - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Krakow, Poland

  • keywords: PLGrid, MEE, GridFTP, GSI SSH, REST API

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

21

  • Secure file storage and access mechanisms in a multi-tenant environment / Jan MEIZNER, Marian BUBAK, Tomasz GUBAŁA, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI // W: KU KDM 2022 : fourteenth ACC Cyfronet AGH HPC users' conference : online, 7-8 April 2022 : proceedings / eds. Kazimierz Wiatr, Jacek Kitowski, Marian Bubak. — Kraków : Academic Computer Centre Cyfronet AGH, 2022. — ISBN: 978-83-61433-40-8. — S. 21–22. — Bibliogr. s. 22. — J. Meizner, M. Bubak, T. Gubała, M. Malawski, P. Nowakowski - dod. afiliacja: Sano Centre for Computational Medicine, Krakow, Poland

  • keywords: security, HPC, FUSE, clouds, webdav, file storage

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Tomasz Gubała, Marek Kasztelnik, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu:

22

  • Secure storage and processing of confidential data on public clouds / Jan MEIZNER, Marian BUBAK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI // W: Parallel Processing and Applied Mathematics : 10th international conference, PPAM 2013 : Warsaw, Poland, September 8–11, 2013 : revised selected papers, Pt. 1 / eds. Roman Wyrzykowski, [et al.]. — Berlin ; Heidelberg : Springer-Verlag, cop. 2014. — (Lecture Notes in Computer Science ; ISSN 0302-9743 ; LNCS 8384. Theoretical Computer Science and General Issues ; ISSN 2512-2010). — ISBN: 978-3-642-55223-6 ; e-ISBN: 978-3-642-55224-3. — S. 272–282. — Bibliogr. s. 282, Abstr.. — Marian Bubak – dod. afiliacja: University of Amsterdam

  • keywords: security, AES, data, hybrid, clouds, 3DES, OpenSSL

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Jan Meizner

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1007/978-3-642-55224-3_26

23

  • Smart levee monitoring and flood decision support system: reference architecture and urgent computing management / Bartosz BALIŚ, Tomasz BARTYŃSKI, Marian BUBAK, Daniel HARĘŻLAK, Marek KASZTELNIK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Maciej PAWLIK, Bartosz WILK // Procedia Computer Science [Dokument elektroniczny]. — Czasopismo elektroniczne ; ISSN 1877-0509. — 2017 vol. 108, s. 2220–2229. — Wymagania systemowe: Adobe Reader. — Bibliogr. s. 2228–2229, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 2017-06-09. — ICCS 2017 : International Conference on Computational Science : 12–14 June 2017, Zurich, Switzerland. — tekst: https://goo.gl/a5dXx1

  • keywords: urgent computing, flood decision support, smart levee monitoring, reference architecture

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.procs.2017.05.192

24

  • Support for Taverna workflows in the VPH-Share cloud platform / Marek KASZTELNIK, Ernesto Coto, Marian BUBAK, Maciej MALAWSKI, Piotr NOWAKOWSKI, Juan Arenas, Alfredo Saglimbeni, Debora Testi, Alejandro F. Frangi // Computer Methods and Programs in Biomedicine ; ISSN 0169-2607. — 2017 vol. 146, s. 37–46. — Bibliogr. s. 45–46, Abstr.. — Publikacja dostępna online od: 20-05-2017. — M. Bubak, M. Malawski - dod. afiliacja: ACC Cyfronet AGH. — tekst: https://goo.gl/Q9cykt

  • keywords: taverna workflow, VPH share, atmosphere cloud, RESTful API

    Zobacz pełny wykaz publikacji Autora/Autorów: Marian Bubak, Maciej Malawski, Marek Kasztelnik

    cyfrowy identyfikator dokumentu: 10.1016/j.cmpb.2017.05.006

25